"Harry Potter und der Halbblutprinz" hatte eine harte Aufgabe: Das Buch ist lang und detailreich und beschäftigt sich mit vielen Figuren und Orten, die sonst nicht in der Geschichte des jungen Zauberers stattfinden. Dementsprechend gibt es viele Punkte aus dem Roman, die nicht im Film stattfinden, das sorgt vor allem im sechsten Teil für manche Verwirrungen. In einem Punkt haben die Macher des Films das Problem aber sehr geschickt gelöst, dass eine Information aus dem Buch rübergebracht werden musste.

Im Roman nimmt die Vergangenheit von Voldemort, als er noch Tom Riddle war, einen recht großen Teil der Geschichte ein. Dumbledore und Harry besuchen durch das Denkarium die Vergangenheit des dunklen Magiers. Ein wichtiger Punkt: die Höhle, in der später das Amulett von Slytherin liegen soll. Diese hat Tom als Junge mit anderen Kindern aus dem Waisenhaus bei einem Ausflug besucht, in den Büchern ist dort etwas so Schreckliches passiert, dass Tom Riddles zwei Begleiter danach völlig verstört sind und auch nicht darüber sprechen wollen. Da aber im Film ein Großteil von Voldemorts Kindheit nicht erzählt wird, unter anderem die Geschichte mit der Höhle, bleibt die Frage offen, warum das Amulett von Slytherin, einer der Horkruxe, dort überhaupt zu finden sein soll.

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Im Film ist zwar zu sehen, wie Dumbledore Harry zeigt, als er Tom Riddle das erste Mal im Waisenhaus besucht, aber die Geschichte der Höhle kommt dabei nicht zur Sprache. Das wird stattdessen über einen Bildschnitt gelöst. Hinter einem Fenstergriff im Zimmer von Tom Riddle befindet sich ein Foto von den Klippen, wo die Höhle zu finden ist – ein Andenken an seinen Urlaub, den er dort verbracht hat. Es ist nur ein ganz kurzer Moment, aber da das Bild in Tom Riddles Zimmer das gleiche ist wie das später im Film, als Dumbledore und Harry vor den Klippen stehen, wird hier kurz, aber genial der Grund für den Ort des Amuletts verraten, ohne dass man das Buch kennen müsste.